鑒於國內傳統漁業逐步轉型為觀光產業，台東縣政府近期推動魚市場交易環境改善計畫，進行縣內新港漁港拍賣場整建第一期工程，包括魚貨不落地交易平台優化、改善魚市場排水環境、集中廢棄物收受管道，工程經費為新台幣680萬元，工程已屆完工。另今年度即將辦理之富岡漁港魚市場改善工程亦已進行設計工作，工程經費預估新台幣450萬，預計於106年12月底前完工，改建富岡漁港魚市場棚架及拍賣地坪。

新港漁港魚市場改善工程除設置漁獲鋼板及桶裝容器降低魚貨受損、受污情形，自漁船卸魚後減少與外界環境接觸機會，迅速交易至承銷者，降低受污風險。台東縣政府也將輔導在地漁會，徹底消毒清潔相關設施設備，嚴格要求魚市攤販環境衛生，並將嚴格抽驗魚貨品質，推展水產品溯源機制。後續將本年度4月底前將提報計畫爭取第二期經費新台幣550萬元，進行魚市場用水管路及產銷環境改建，台東縣政府縣長黃健庭要求持續嚴格把關食品衛生環境，讓生鮮魚獲維持品質，使消費者能食的更安心、健康。