雲林縣動植物防疫所1月9日接獲元長鄉一處主動通報場內雞隻不明原因大量死亡，當日派員到場進行移動管制並採樣送行政院農業委員會家畜衛生試驗所檢驗。檢驗報告12日傍晚確診為H5N2高病原性禽流感陽性反應，縣防疫所同日採取撲殺清場作業，共計撲殺16,801隻49日齡黑羽土雞，並針對場內外及周邊環境進行清潔消毒作業。

縣防疫所表示，近日發生禽流感陽性場分別位於莿桐、斗南、麥寮、台西及元長，已針對該等禽場之飼料供應、化製車輛、運禽車輛等進行分析，惟之間並無交叉污染跡象，顯示無地緣關係，疫情發展仍待密切觀察。

防疫人員指出，近來因氣候不穩定，日夜溫差大，是禽類呼吸道疾病的好發季節，業者應落實各項生物安全措施，每週三擴大同步消毒，嚴密注意每一個進入場區人員，是否徹底消毒，同時檢視防鳥網具是否完整，場區內有無野鳥出沒，才能遠離疫病威脅。也呼籲養禽業者，自主觀察場內禽隻健康情形，如有發現所飼養家禽死亡率大於0.4%，務必於24小時內通報，以防範禽流感疫情蔓延，確保家禽產業安全。