一分局表示，方嫌案發後輾轉透過友人謝維哲協助，逃至屏東縣高樹鄉某砂石場窩藏，一分局22日調派幹員南下該砂石場查緝，方嫌狡詐趁隙逃脫，聯繫謝維哲至屏東協助逃回臺南，詎料，謝維哲日前因故夥同其他友人持磚塊怒砸永康分局大橋派出所，而遭永康分局全面追緝，23日凌晨警方到南市中西區西賢六街的陳姓少年住處圍捕方琮淵時，方爬上頂樓、持槍拒捕，還把槍口抵住自己脖子、揚言要自殺，與警方僵持約一小時，後在刑事小隊長劉嘉慶勸說下，方才棄槍投降。
警方在方嫌身上搜出一把改造手槍；另在謝維哲車上找到兩把改造手槍，3把手槍與20多顆子彈都是方嫌所有。據警方調查，8日凌晨在南市東區、安平區兩件槍擊案都是方琮淵與同夥綽號「小隻德」 的吳姓男子、陳姓男子所為；方琮淵向警方坦承兩件槍擊案都是他開槍的，訊後移送臺灣臺南地方法院檢察署偵辦。
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