台北市長柯文哲在出席研討會時,針對國姓爺鄭成功說出精神錯亂代表這番言論,讓台南家廟相當不以為然,認為言論是影響族群融合,以及對鄭成功的不尊重,對於柯市長的個人言論,不予置評。