強颱杜鵑來襲，高鐵、台鐵、航空與離島航線28日中午過後紛紛取消服務，嚴重衝擊到民眾中秋節收假計畫。台鐵上午更緊急加開花東到台北車次，紓解北返人潮。預計29日中午後颱風暴風圈逐漸遠離台灣，交通才會完全恢復。

由於強颱杜鵑為台灣各地帶來不小的雨量和風勢，陸海空交通都受到影響。桃園機場28日上午雖然維持客機正常起降，但隨著越晚風雨加大，28日下午到29日中午之前，可能將有超過300個航班陸續取消或延後，旅客搭機前應先瞭解各航空公司起落降資訊。

台鐵28日上午宣布西部幹線北上下午4時後停駛，南下最後1班車139次自強號於傍晚5時開行，之後全面停駛；南迴鐵路則於傍晚6時停駛。東部幹線上午10時由台北、台東各發完1班列車後停駛，並開放普悠瑪全車自由座，不過由於北返民眾相當多，台鐵也緊急加開列車輸運人潮。台北車站站長黃榮華說：『(原音)今天除了原來10時以前表定時刻正常開了以外，我們又臨時加開了5列次，輸運了4,250人。』

高鐵上午台北、台中、高雄等站同樣出現眾多人潮，高鐵公司也宣布28日下午3時之後各車次取消服務。國道高速公路局則取消原定28日高承載管制及入口匝道封閉措施。